中華農業文明研究院是一個開放型的學術機構。它實行院務委員會領導下的院長負責制，以專職研究人員為核心，兼職人員、國內外訪問學者及博士后研究人員為外圍，以科研項目為紐帶，集全國農業史、科學技術史之力量，開展廣泛的科學研究、人才培養和信息收集與傳播的工作。