院長： 王思明 教授

院支部書記： 沈志忠 教授

副院長： 夏如兵 副教授

副院長： 何紅中 副教授

研究生辦主任： 夏如兵 副教授（兼）
           副主任： 李昕升 博士

科研辦主任： 劉馨秋 副教授

《中國農史》編輯部主任： 沈志忠 副主編（兼）

聯合研究中心：

普渡大學-南京農業大學中國研究聯合中心主任： 王思明 教授
                                                                Douglas Hurt教授
世界農業傳播聯合研究中心主任： 王思明 教授（南京農業大學）
                                                      Martin Bell教授（雷丁大學）
中日農史比較研究中心主任： 衣保中 教授（南京農業大學）
                                                 黑瀧秀久 教授（東京農業大學）

 
省部研究基地：

江蘇省高校哲學社會科學重點研究基地-中國農業歷史研究中心主任： 王思明 教授

江蘇省非物質文化遺產重點研究基地主任： 王思明 教授

院級研究中心：

作物史研究中心主任： 惠富平 教授
                      副主任： 何紅中 副教授

畜牧獸醫史研究中心主任： 李    群 教授

農史文獻數字化研發中心主任： 包    平 教授

中國近現代農業史研究中心主任： 夏如兵 副教授

中國農業文化遺產保護研究中心主任： 李    明 副教授
                                         副主任： 劉馨秋 副教授